شیوه های تدریس اخلاقیات از تدریس سایر موضوع ها (مثل ریاضیات و زبان ژاپنی) متفاوت است. در کلاس اخلاق از هیچ گونه کتاب درسی استفاده به عمل نمی آید و بیشتر جلسات از طریق ایجاد بحث بین معلم و شاگردان و با یاری گرفتن از برنامه های تلویزیون آموزشی، اسلاید و ضبط صوت برگزار می شود. در بعضی از موارد مطالب خواندنی را که معلم اخلاق خود تهیه کرده و یا از طریق شرکت های انتشاراتی به طبع رسیده است، برای دانش آموزان قرائت می کنند.
در پرتو عنایت خداوند متعال و توجهات حضرت ولیعصر (عج) و پیرو تاکید مقام معظم رهبری بر تلاش در عرصه نوسازی و اعتلای پژوهش‌های دینی و اسلامی با حداکثر استفاده از روش‌ها و ابزارهای جدید به امر مرجع عالیقدر حضرت آیه الله العظمی مظاهری دامت برکاته در آذرماه سال ۱۳۷۷ تاسیس شده است.
تا کنون گام‌های موثر و چشمگیری در راستای پیشبرد و اعتلای پژوهش‌های اسلامی برداشته که علاوه بر تولید ده‌ها نرم‌افزار دینی، به تحقیق و انتشار کتب مفیدی دست زده است که تاثیر این تحول بنیادی مورد توجه و قبول عالمان، محققان و اندیشمندان جامعه اسلامی قرار گرفته است و تاکنون توانسته رتبه‌های متعددی از جمله خادم قرآن کریم (۱۳۸۴) و خادم فرهنگ عمومی (۱۳۸۶) کسب نماید.
